СМПР представляет собой прямоугольный корпус с магнитной системой из мощных магнитов на основе ферритов или редкоземельного сплава. На верхней части корпуса располагаются петли для подвеса сепаратора. В нижней части располагается шибер (сдвижной лист) для механической очистки сепаратора от собранных ферромагнитных включений.
Обрабатываемый материал, двигаясь по ленточному или другого вида конвейеру, попадает в мощное магнитное поле, создаваемое магнитной системой СМПР. Под действием этого поля ферромагнитные включения притягиваются к рабочей поверхности сепаратора, а немагнитный сепарированный продукт, двигаясь дальше по конвейеру, переходит на следующую стадию транспортировки.
В конце каждой рабочей смены производится очистка поверхности сепаратора механическим способом путём сдвига шибера вручную, при этом собранные за смену ферромагнитные включения выходят из магнитного поля и опадают в специальный контейнер.